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全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌的鉴定能力评估

作者: 发布时间:2019-12-17 19:51:49 阅读: 89 次

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全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌的鉴定能力评估

 

摘要:目的:评估全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌的鉴定能力方法:分别采用Vitek 2 Compact鉴定方法以及常规细菌鉴定方法对肠杆菌科细菌中的埃希菌属、克雷伯菌属以及肠杆菌属进行鉴定,观察两种方法的鉴定结果。结果:常规Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统鉴定肠杆菌科细菌,埃希菌属鉴定到种、肠杆菌属中,71%鉴定到种,与常规革兰氏染色等鉴定方法相比,优势显著(p<0.05)。结论:应将Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统应用到肠杆菌科细菌的鉴定过程中,确保细菌可鉴定到属,降低鉴定错误或未鉴出问题的发生几率,为疾病的有效控制提供保证。

关键词:全自动微生物分析系统肠杆菌科细菌鉴定能力评估

 

前言:肠杆菌科细菌是导致感染疫情大面积爆发的主要因素,对人类健康影响较大,采用全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌进行鉴定,对疾病的控制具有重要价值。本文采用实验的方法,对Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统对肠杆菌科细菌的鉴定能力进行了评估:

1 材料与方法

1.1 仪器与试剂

1.1.1 仪器准备

1)Vitek 2 Compact及相应革兰阴性杆菌鉴定卡。(2)常规细菌鉴定所需仪器(包括显微镜等)。(3)Mastercycler EP Gradient Thermal Cycler聚合酶连反应仪。(4)DNA测序仪。

1.1.2 试剂准备

1)PCR扩增试剂盒。(2)乙腈。(3)三氟乙酸.(4)乙醇。

1.2 鉴定方法

1.2.1 Vitek 2 Compact鉴定方法

1)准备纯菌落。(2)0.5麦氏单位浓度菌悬液。(3)鉴定。

1.2.2 常规细菌鉴定方法

    采用常规革兰氏染色方法,对细菌进行鉴定,具体方法如下:(1)准备菌落。(2)涂布于干净玻片蒸馏水中,风干并固定。(3)染色1min。(4)水洗后碘液作用1min。(5)水洗、脱色、番红染色3min。(6)水洗,风干。(7)采用显微镜观察。

1.2.3 血清凝集试验方法

采用标准操作流程,做血清凝集试验。

1.2.4 基因测序方法

    1)采用水煮法提取基因组DNA,以其为模板,进行PCR扩增。(2)扩增产物,采用琼脂糖凝胶电泳方法处理,得到琼脂凝胶块。(3)采用310测序仪测序。

1.3 观察指标

观察不同方法对埃希菌属的鉴定结果。

观察不同方法对克雷伯菌属的鉴定结果。

观察不同方法对肠杆菌属的鉴定结果。

1.4 统计学方法

采用统计学软件 SPSS 21.0处理数据,p<0.05时,认为数据对比具有统计学差异。

2 结果

2.1 不同方法对埃希菌属的鉴定结果

不同方法对埃希菌属的鉴定结果如表1:

1 不同方法对埃希菌属的鉴定结果

方法

Vitek 2 Compact(100株)

常规细菌鉴定方法(100株)

鉴定情况

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

结果

100(100)

0(0)

0(0)

98(98)

0(0)

2(2)

    通过表1可以看出,采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统鉴定埃希菌属,鉴定到种的几率为,无鉴定错误或未鉴出问题发生。采用常规细菌鉴定方法鉴定埃希菌属,鉴定到种的几率为98%,无鉴定错误,2例未鉴出。两组对比,统计学差异显著(p<0.05)。

2.2 不同方法对克雷伯菌属的鉴定结果

不同方法对克雷伯菌属的鉴定结果如表2:

2 不同方法对克雷伯菌属的鉴定结果

方法

Vitek 2 Compact(100株)

常规细菌鉴定方法(100株)

鉴定情况

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

结果

100(100)

0(0)

0(0)

100(100)

0(0)

0(0)

    通过表2可以看出,采用常规细菌鉴定方法或Vitek 2 Compac全自动微生物分析系统鉴定克雷伯菌属,鉴定到种的几均为,无鉴定错误或未鉴出问题发生,两者对比,无统计学差异(p>0.05)。

2.3 不同方法对肠杆菌属的鉴定结果

不同方法对肠杆菌属的鉴定结果如表3:

3 不同方法对肠杆菌属的鉴定结果

方法

Vitek 2 Compact(100株)

常规细菌鉴定方法(100株)

鉴定情况

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

鉴定到种(n/%)

鉴定错误(n/%)

未鉴定出(n/%)

结果

71(71)

0(0)

0(0)

22(22)

0(0)

0(0)

    通过表3可以看出,采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统鉴定肠杆菌属,鉴定到种的几率为71%,采用常规细菌鉴定方法鉴定肠杆菌属,鉴定到种的几率为22%,两组对比,统计学差异显著(p<0.05)。

3 讨论

细菌是导致各类疾病产生与传播的根源,是导致各类疫情大面积爆发的主要因素,对人类健康会产生极大的不良影响。加强对各类细菌的鉴定,是对其加以控制的主要途径,是疾控中心用于监测或控制疾病传播的主要方法。

3.1 常规细菌鉴定方法

常规细菌鉴定方法,包括革兰氏染色、芽孢染色、抗酸染色等,用于鉴定以肠杆菌科细菌为主的各类细菌,效果欠佳。本文研究发现,采用常规革兰氏染色方法鉴定埃希菌属,鉴定到种的几率为98%,无鉴定错误,2例未鉴出。鉴定克雷伯菌属,鉴定到种的几均为,无鉴定错误或未鉴出问题发生。鉴定肠杆菌属,鉴定到种的几率为22%。

3.2 Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统

    Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统是目前疾控中心用于鉴定各类细菌的主要系统,具有应用简单方便,鉴定效率高的特点,且具有较高的技术含量,鉴定中出现错误的几率低,鉴定到种的几率高,具有较高的应用价值。本文研究发现,采用Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统鉴定埃希菌属,鉴定到种的几率为,无鉴定错误或未鉴出问题发生。鉴定克雷伯菌属,鉴定到种的几均为。鉴定肠杆菌属,鉴定到种的几率为71%。与常规细菌鉴定方法相比,具有显著统计学差异(p<0.05)。

结论:

    应将Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统应用到肠杆菌科细菌的鉴定过程中,确保细菌可鉴定到属,降低鉴定错误或未鉴出问题的发生几率,为疾病的控制提高参考。